Terwijl ze in de kelder van Oom Dagobert’s landhuis zijn, ontdekken Kwik, Kwek en Kwak een oud stuk papier. Wanneer ze het aan Oom Dagobert laten zien, herkent hij het als onderdeel van de legendarische schatkaart van zijn overgrootoom Fergus Duck! De resterende delen van de kaart liggen over de hele wereld verborgen, dus het is aan Oom Dagobert om ze te vinden en de geheime schat van Fergus Duck te ontdekken!
Duck Tales 2 is het vervolg op de NES- en Game Boy-game Duck Tales. Gebaseerd op de gelijknamige Disney-tekenfilm, besturen spelers Oom Dagobert terwijl hij de wereld afzoekt naar enorme hoeveelheden rijkdom terwijl hij probeert verborgen stukken van de kaart te ontdekken.
De belangrijkste aanvalsmethode van Dagobert is zijn wandelstok – door in de lucht te springen en de B-knop ingedrukt te houden, verandert de wandelstok in een pogo-stick, waardoor spelers op de hoofden van de meeste vijanden kunnen springen en met gemak gevaarlijk terrein kunnen oversteken als spikes. Door tegen een muur of een object te duwen, zal Scrooge zijn wandelstok slaan als een golfclub, waardoor het object door de lucht vliegt of af en toe geheime items onthult. Nieuw in Duck Tales 2 is de mogelijkheid om bepaalde objecten met de wandelstok te duwen en te trekken nadat je ze hebt geraakt.
Bekende gezichten zoals Kwik, Kwek en Kwak, Webby, Mrs. Beakley en Launchpad McQuack komen allemaal opdagen om een handje te helpen. Scrooge zal zelfs de gekke uitvinder, Willie Gearloose, tegenkomen, die Scrooge’s wandelstok zal verbeteren zodat hij toegang heeft tot nog meer geheime gebieden.