Moto Racer Advance is de eerste aanpassing van de motorraceserie voor een handheldplatform. Het kernconcept is vergelijkbaar met de originele games: spelers racen op asfalt of terreinbanen. De game biedt verschillende spelmodi: single race, championship, league en progression. De laatste is de hoofdmodus van de game, omdat het een pad biedt voor de drie belangrijkste racestijlen: Cross, GP en Traffic. Door races te winnen worden extra locaties, motoren en trucs ontgrendeld. Elk van de drie paden kan afzonderlijk worden gevolgd, ze hoeven niet in een specifieke volgorde te worden voltooid. Een vierde stijl genaamd Ultimate wordt later in de game ontgrendeld.
Fietsen hebben verschillende statistieken op basis van maximale snelheid, acceleratie, remmen en grip. Enkele van de beschikbare locaties zijn Californië, Engeland, Kenia, Moskou en San Francisco. GP-circuits hebben een vast aantal ronden en een aantal tegenstanders moet worden ingehaald voordat de finishlijn wordt bereikt. Het legt de nadruk op het effectief gebruiken van remmen om vloeiend door bochten te gaan. De offroad-terreincircuits in de Cross-modus zijn qua concept vergelijkbaar, maar vereisen beheersing van powersliding om bochten te passeren. Ze hebben ook hobbels en ruwer terrein. De verkeersstijl is een mix met beide soorten terrein, maar introduceert AI-gestuurd verkeer dat moet worden ontweken. Borden boven de racer geven aankomende bochten aan met een andere kleur op basis van de scherpte en ze waarschuwen ook voor obstakels. Tijdens het racen is een nitro beschikbaar om een wheelie te doen en meer snelheid te krijgen. Het kan worden uitgeput, maar regenereert na verloop van tijd. Bovenaan het scherm staat de tijd en wordt een horizontale balk weergegeven met de posities van alle rijders.
Multiplayer-games voor maximaal vier racers tegelijk zijn beschikbaar via een verbindingskabel.