Samantha Swift is een archeologe die de wereld rondreist om verloren artefacten te vinden. In een van haar avonturen vindt ze het Schild van Athene, een magisch object versierd met zes rozen. Samantha moet de zes bloemen terughalen terwijl ze twee agressieve grafrovers, Ravena Stryke en Markus Payne, ontwijkt.
Samantha Swift and the Hidden Roses of Athena is een zoek-en-vind-spel met avontuurlijke elementen. De speler moet objecten verzamelen van een lijst die onder aan het scherm wordt weergegeven. Sommige van deze objecten worden opgeslagen in een apart tabblad met hulpmiddelen onderaan, dat fungeert als een inventaris, waar de objecten kunnen worden opgepakt en gebruikt op bepaalde delen van het landschap om puzzels op te lossen. De naam van een object wordt blauw gemarkeerd wanneer het alleen verschijnt nadat een puzzel is opgelost.
Wanneer je over een interactief deel van het scherm gaat, verandert de cursor in een blauwe pijl met tandwielen. Wanneer je over een deel van het landschap gaat met een close-upafbeelding, verandert de cursor in een groene pijl met een vergrootglas. Sommige locaties hebben meer dan één scherm, waar de speler heen en weer moet gaan om de benodigde objecten te verzamelen om de puzzels op te lossen.
Bliksemschichten zijn verborgen op het scherm en geven extra hints wanneer ze worden verzameld. Wanneer op items in de lijst wordt geklikt, toont de scanner linksonder hun silhouetten.